真實(shí)色共焦顯微鏡與激光掃描共焦顯微鏡，二者在成像原理上基本是一樣的，*大不同之處是照明光源不同。1、激光掃描共焦顯微鏡激光掃描共焦顯微鏡的照明光源是激光，即單色光。其實(shí)際成像過(guò)程是根據(jù)被觀察物體對(duì)該單色激光的反射光的強(qiáng)弱來(lái)成像的。由于是單色光照明，不能分辨顏色，對(duì)于在同一試樣的同一視場(chǎng)內(nèi)，顏色不同，但對(duì)該單色激光反射光強(qiáng)度相同的不同組織或成分不能分辨。容易產(chǎn)生同相異色，同色異相的現(xiàn)象，不利于對(duì)微觀組織和成分的正確分辨。2、真實(shí)色共焦顯微鏡真實(shí)色共焦顯微鏡的光源是氙光源，即白光。其實(shí)際成像過(guò)程是在白光照明的條件下，對(duì)物體形貌（包括顏色）進(jìn)行綜合的成像。由于是多色光照明和成像，真實(shí)色共焦顯微鏡能夠更真實(shí)的反應(yīng)物體的顏色和形貌，避免了激光掃描共焦顯微鏡產(chǎn)生的同相異色，同色異相的現(xiàn)象發(fā)生，觀察者可以通過(guò)顏色，分辨和判斷試樣的成分和組織。在這方面，其分辨率遠(yuǎn)強(qiáng)于激光掃描共焦顯微鏡綜合分析：在有顏色差異的試樣的觀察條件下，真實(shí)色共焦顯微鏡避免了激光掃描共焦顯微鏡產(chǎn)生的同相異色，同色異相的現(xiàn)象發(fā)生，觀察者可以通過(guò)顏色，分辨和判斷試樣的成分和組織。在這種條件下，真實(shí)色共焦顯微鏡的分辨率高于激光掃描共焦顯微鏡。在單色試樣的觀察條件下，分辨率才接近各自的技術(shù)指標(biāo) 。然而，在實(shí)際觀察的試樣中，絕大多數(shù)不同的組織和成分都是有顏色差異的。對(duì)應(yīng)于沒(méi)有顏色差異或顏色差異小的試樣，可以通過(guò)人為的染色（例如腐蝕處理），提高圖像的分辨能力。在這一方面，激光掃描共焦顯微鏡是無(wú)能為力的。另外，分辨率是在特定條件下所能達(dá)到的一項(xiàng)技術(shù)指標(biāo)，當(dāng)在實(shí)際使用中，不滿足該技術(shù)條件時(shí)（實(shí)際是常常不能滿足），其分辨率是達(dá)不到所給出的數(shù)值。下圖是鎳鉻合金在普通單色激光共聚焦顯微鏡中的成像，以及使用真實(shí)色共聚焦顯微鏡所成圖像的對(duì)比，其中紅圈內(nèi)是不同的化合物摻雜，可以清楚看到用單色激光共聚焦顯微鏡所成的圖像，僅憑灰度是無(wú)法準(zhǔn)確反應(yīng)其中化合物摻雜的區(qū)別的，而真實(shí)色共聚焦卻可以清楚區(qū)分他們的不同。